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姓名:黄蕾

职称/职务:讲师

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电子信箱:caspar@snnu.edu.cn

研究方向:植物进化生物学、群体基因组学

办公地点:

 

一、个人简介

本人于2003.09-2006.06就读于中国农业大学生命科学实验班, 获理学学士学位;2006.09-2012.06就读于中国科学院植物研究所系统与进化国家重点实验室,获理学博士学位。硕博连读期间,从事稻属群体基因组学研究,以及野生稻两类生态型物种形成机制的探讨。博士毕业后,在中科院植物所系统与进化国家重点实验室任项目科研助理,参与实验室管理和相关科研项目。

2014.01-2019.11进入陕西师范大学生命科学学院博士后流动站,与任毅教授合作,从事耧斗菜与箭竹属的物种分化研究。出站后,留任陕师大生命科学学院,继续从事植物进化生物学研究。

 

二、主要研究领域及兴趣

1.以箭竹和黄花蒿等为代表,阐明植物适应性进化与物种形成的机制, 并关注重要代谢途径的分子进化和群体动态;

2.综合利用基因组、转录组、蛋白组、表观遗传学等数据探讨近缘物种分化的遗传机制,筛选参与物种形成的关键基因;

3.关注重要性状在近缘物种分化中的进化动态,结合进化发育学的研究手段,探讨自然选择对该性状的作用机制,以及该性状如何参与物种适应性建立。

 

三、承担的科研项目

1. 主持国家自然科学基金青年基金项目,基于多个基因序列探讨华北耧斗菜复合体内无距性状的起源问题(项目名称),2018.1.1-2020.12.3131700180(项目批号)

 

四、代表性论文

1. Huang L, Geng F-D, Xue C, Fan J-J, Zhang X-Y, Kang J-Q, Zhang J-Q, Ren Y. Genetic diversity and evolutionary history of four closely related Aquilegia species revealed by ten nuclear gene fragments. Journal of Systematics and Evolution 2018 56(2): 129-138.

2. Huang L, Xing X-C, Li W-W, Zhou Y, Zhang Y-Q, Yi Ren, Kang J-Q. Altitude difference might contribute to the genetic divergence of giant panda’ staple food Bamboo (Fargesia spathacea Franch complex) based on 14 SSR markers. Journal of Systematics and Evolution 2020 (doi:10.1111/jse.12594).

3. Huang L, Du Y-SZheng X-MLiu RZhou H-F, Ge S. Nucleotide diversity of 11S seed storage protein gene and its implications for ecological adaptation of Oryza nivara. Journal of Systematics and Evolution 2013 51: 641-651.

4.Cai Z, Zhou L, Ren N-N, Xu X, Liu R, Huang L, Zheng X-M, et al. Parallel speciation of wild rice associated with habitat shifts. Molecular Biology and Evolution 2019 36: 875–889.

5.Xue C, Geng F-D, Zhang X-Y, Chang X-P, Kang J-Q, Huang L, Zhang J-Q, Ren Y. Pattern of variation in the morphological characteristics of Aquilegia ecalcarata and its closely related species. Journal of Systematics and Evolution 2019 (doi: 10.1111/jse.12494)

6.Zhang Y-Q, Zhou Y, Hou X-Q, Huang L, Kang J-Q, Zhang J-Q, Ren Y. Phylogeny of Fargesia (Poaceae: Bambusoideae) and infrageneric adaptive divergence inferred from three cpDNA and nrITS sequence data. Plant Systematics and Evolution 2019 305: 61–75.

7.Wang X-M, Feng L, Zhou T, Ruhsam M, Huang L, Hou X-Q, Sun X-J, Fan K, Huang M, Zhou Y, Song J. Genetic and chemical differentiation characterizes top-geoherb and non-top-geoherb areas in the TCM herb rhubarb. Scientific Reports 2018 8: 9424.

8.Guo JLiu RHuang LZheng X-MLiu P-LDu Y-SCai ZZhou LWei X-H, Zhang F-MGe Song. Widespread and adaptive alterations in genome-wide gene expression associated with ecological divergence of two Oryza species. Molecular Biology and Evolution 2016 33: 62-78.

9.Wang C-HZheng X-MXu QYuan X-PHuang L, Zhou HWei X-H, Ge S. Genetic diversity and classification of Oryza sativa with emphasis on Chinese rice germplasm. Heredity 2014 112: 489-496.

10.Xu XLiu XGe SJensen J-DHu FLi XDong YGutenkunst R-NFang LHuang L, Li J-XHe W-MZhang G-JZheng X-MZhang F-MLi Y-RYu CKristiansen KZhang X-QWang JWright MMcCouch SNielsen RWang J, Wang W. Resequencing 50 accessionsof cultivated and wild rice yields markers for identifying agronomically important genes. Nature Biotechnology 2012 30: 105-111.